يتم إيفاد ستة طلبة من كل لواء من ألوية المملكة في حين يتم مضاعفة حصة المحافظات التي لا يوجد فيها أكثر من كل لواء واحد. في حال تساوت النقاط التي يحصل عليها طالبين أو أكثر في نفس اللواء فيحصلون جميعهم على منحة دراسية بغض النظر عن الحصة المقررة لكل لواء. لا يستفيد من هذا البرنامج أي طالب تم الموافقة على تخصيص منحة دراسية لأخ أو أخت له على حساب هذا البرنامج. تخصيص المنح الدراسية للمستفيدين لمرة واحدة فقط ولمرحلة جامعية واحدة. تشمل البعثة رسوم الساعات الدراسية فقط للفصلين الأول والثاني.

تتولى وزارة التعليم العالي تدقيق القوائم الواردة من الجامعات بعد أن يتم دمجها بالاستناد إلى التقسيمات الإدارية للمملكة ، ومن ثم التنسيب بالموافقة على قرارات الابتعاث للصندوق بأسماء الطلبة الذين حصلوا على أعلى النقاط في كل لواء من ألوية المملكة. يتم تشكيل لجنة اختيار برئاسة أمين عام وزارة التعليم العالي وعضوية ممثل عن الجامعات الحكومية وممثل عن الصندوق إضافة إلى اثنين من كبار موظفي وزارة التعليم العالي والبحث العلمي لتتولى الإشراف على إعداد قوائم المرشحين للابتعاث ، ومن ثم تنسيب اللجنة إلى دولة رئيس مجلس الأمناء أو من يفوضه بإصدار قرارات الإبتعاث للطلبة الذين حصلوا على أعلى النقاط في كل لواء من ألوية المملكة. يتم الإعلان عن أسماء المبعوثين كما يتم فتح باب الاعتراض لمدة أسبوع اعتبارا من تاريخ إعلان أسماء المرشحين.

في نهاية كل فصل يقدم كل طالب حصل على منحة دراسية كشف علامات مصدق من الجامعة التي يدرس فيها عن الفصل الدراسي السابق مع تقديم ما يثبت عدم إيقاع أي عقوبة تأديبية عليه. في حال انخفض تقدير الطالب المستفيد من المنحة عن مقبول تحجب المنحة جزئيا ولا يتم دفع أثمان الساعات المعتمدة للمواد المعادة. بعد نهاية الفصل الذي حجبت فيه المنحة جزئيا يقدم الطالب كشف علامات جديد وفي حال رفع تقديره إلى مقبول يتم إعادة المنحة الدراسية له ابتداء من الفصل الدراسي المقبل. إذا لم يتمكن الطالب من رفع تقديره إلى مقبول بعد فصلين دراسيين من حجب المنحة جزئيا ، فيتم حجب المنحة الدراسية نهائيا. إذا حصل الطالب على أي عقوبة تأديبية نتيجة لارتكابه مخالفات تمس بالشرف أو الأمانة من الجامعة التي يدرس فيها فيتم حجب المنحة لمدة فصلين دراسيين.