تأسس مركز العقبة للتعليم والتدريب البحري في 15/9/2014 كفرع من مركز الاستشارات والدراسات والتدريب، وبتاريخ 12/1/2017 صدر قرار مجلس الأمناء بإنشاء مركز العقبة للتعليم والتدريب البحري بشكل مستقل عن مركز الاستشارات داخل حرم كلية العقبة الجامعية، وبإدارة مستقلة عن الكلية، ويتم تنفيذ البرامج التدريبية بالتعاون مع القطاع الخاص ممثلاً بالإتلاف الاستشاري البحري الذي يزود المركز بالمدرسين البحريين المؤهلين حسب اتفاقية التعاون الموقعة بين الجامعة والإتلاف الاستشاري البحري، بالإضافة لتقديم خدمات التعليم والتدريب البحري في المنطقة ويطبق المركز متطلبات وزارة التعليم العالي ووزارة النقل ممثلة بالهيئة البحرية الأردنية، والالتزام بتطبيق تشريعات المنظمة البحرية العالمية IMO ووفقا لأحكام الاتفاقية الدولية لمستويات التدريب واصدار الشهادات STCW78 وتعديلاته، كما أن المركز حاصل على شهادة الجودة (ISO9001-2015) من هيئة التصنيف الفرنسية BV Burean Veritas في التعليم والتدريب البحري. دأبت جامعة البلقاء التطبيقية منذ نشأتها بتطوير البرامج التعليمية والتدريبية لخدمة المجتمع المحلي والاقليمي من خلال استحداث التخصصات والبرامج المتخصصة لتطوير العنصر البشري والمراكز التعليمية والتدريبية المتخصصة في مجالات محددة. إن الكوادر البحرية هي من الوظائف النادرة ويعتبر السوق البحري غير مشبع بالكوادر المؤهلة للعمل في مجال النقل البحري بكافة قطاعاته سواء على المستوى الدولي أو المحلي. ومواكبة لخطط التنمية في المملكة الأردنية الهاشمية واستجابة للنداء الوطني واستراتيجية وزارة النقل بإنشاء كليات بحرية في الجامعات الرسمية فقد استشعرت جامعة البلقاء التطبيقية أهمية التجاوب مع الطلب المتزايد من الجهات والهيئات التي لها علاقة وثيقة بصناعة النقل البحري وبالتالي قامت باستحداث تخصصات بكالوريوس تكنولوجيا النقل البحري ودبلوم الهندسة البحري في كلية العقبة الجامعية في عام 2013 بهدف اعداد الكوادر البحرية للعمل على ظهر السفن والكفاءات المتميزة في إدارة وتشغيل الموانئ وأعمال النقل البحري حسب المعايير العالمية. حيث إن برنامج تكنولوجيا النقل البحري ودبلوم الهندسة البحرية صممت حسب متطلبات المنظمة البحرية الدولية IMO ومتطلبات الاتفاقية الدولية STCW78 وتعديلاتها ومتطلبات الهيئة البحرية الأردنية والتي بمقتضاها يحصل الطالب على شهادة البكالوريوس في تكنولوجيا النقل البحري أو شهادة دبلوم في الهندسة البحرية معتمدتين من وزارة التعليم العالي والبحث العلمي والهيئة البحرية الأردنية.